Peu de temps après sa victoire face à Shishio Makoto, Kenshin est retourné vivre auprès de Kaoru. Notre héros coule désormais des jours heureux et paisibles mais cette paix est une nouvelle fois menacée par un un sombre individu dénommé Enishi Yukishiro qui prône le jugement des hommes. D’après de vieilles rumeurs, ce dernier ne serait autre que l’ancien beau-frère de Kenshin.